根据一些实验证据证实角膜干细胞位于角膜缘。如角膜缘基底细胞中唯一不表达角质蛋白K3的细胞，表示该细胞处于未分化状态；角膜缘上皮细胞的增生能力明显高于角膜中央上皮细胞；角膜基底细胞的损伤导致角膜上皮的完整性破坏，创伤愈合障碍等；角膜缘上皮细胞移植可以修复角膜上皮细胞缺损，等等。
角膜缘的微环境对维持角膜干细胞的生物特性具有重要意义，作为阻止结膜上皮进入角膜的屏障，角膜缘损伤将导致各种干细胞功能障碍。如果干细胞功能低下甚至细胞缺失，将使角膜上皮增生能力丧失。角膜缘屏障功能下降，可导致结膜上皮长入，角膜上皮增厚，表面不规则，细胞不稳定，新生血管长入，炎性细胞浸润和角膜上皮基地膜破坏。